Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4bP46467 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps4bP46467 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms