Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms