Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfamP40630 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfamP40630 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfamP40630 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms