Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VhlP40338 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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VhlP40338 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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VhlP40338 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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VhlP40338 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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VhlP40338 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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VhlP40338 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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VhlP40338 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VhlP40338 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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VhlP40338 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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VhlP40338 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VhlP40338 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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