Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ThpoP40226 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ThpoP40226 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ThpoP40226 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ThpoP40226 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ThpoP40226 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ThpoP40226 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms