Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Grik2P39087 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms