Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms