Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms