Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms