Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprmP28828 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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