Protein–RNA interactions for Protein: P27889

Hnf1b, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf1bP27889 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hnf1bP27889 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hnf1bP27889 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms