Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lef1P27782 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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