Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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