Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms