Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gria2P23819 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gria2P23819 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms