Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PparaP23204 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PparaP23204 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PparaP23204 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PparaP23204 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms