Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms