Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P20040 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P20040 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P20040 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P20040 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P20040 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P20040 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
P20040 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P20040 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P20040 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P20040 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P20040 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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