Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifrd1P19182 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms