Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms