Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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