Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabra6P16305 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabra6P16305 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms