Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd44P15379 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms