Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54P14576 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms