Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rb1P13405 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms