Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb1P13372 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms