Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr4a1P12813 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms