Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP11369 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PolP11369 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP11369 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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