Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms