Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P10404 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P10404 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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