Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnfP06804 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnfP06804 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnfP06804 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TnfP06804 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TnfP06804 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TnfP06804 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TnfP06804 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnfP06804 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnfP06804 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms