Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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