Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P01741 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P01741 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P01741 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P01741 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P01741 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms