Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01658 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
P01658 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P01658 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P01658 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P01658 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P01658 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P01658 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01658 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P01658 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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