Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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P01649 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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P01649 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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P01649 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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P01649 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P01649 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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P01649 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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P01649 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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P01649 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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P01649 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01649 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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P01649 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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P01649 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01649 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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