Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01648 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01648 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01648 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01648 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01648 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01648 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01648 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01648 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01648 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01648 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms