Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShdO88834 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShdO88834 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms