Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
F11rO88792 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
F11rO88792 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
F11rO88792 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F11rO88792 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms