Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kcnk4O88454 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kcnk4O88454 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kcnk4O88454 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kcnk4O88454 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kcnk4O88454 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kcnk4O88454 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kcnk4O88454 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms