Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtssO70370 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtssO70370 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CtssO70370 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtssO70370 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtssO70370 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtssO70370 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtssO70370 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtssO70370 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms