Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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