Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms