Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr1O55100 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms