Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs5O54928 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms