Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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