Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc1a6O35544 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc1a6O35544 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms