Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms