Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc1O35379 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms