Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f3O35261 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms