Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmd4O35226 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmd4O35226 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms